我国第1批的9所大学你或许不能张口说出来，但是不在其中的南开大学或许却是如雷贯耳。从早些年的“清北开复”到“清北复开”，再到如今的“清北复交”，南开大学不但总体呈下降趋势，并且被挤出了四大名校的行列，被上海交通大学迎头超过。即使现在，对比同城的大学天津大学，也很难说稳胜，只能说在伯仲之间，如果从第4轮学科评估来看的话，没有A+学科的南开大学更是无地自容。南开大学拆分合并，曾经成就了3所大学，年曾一度有希望成为第10所大学，组成“C10”大学，只可惜造化弄人！
南开大学首届学生的合影中，共有96个身影，其中62号学生就是那位喊出了“为中华崛起而读书”的伟人。年南开大学的创办人张伯苓，在南开大学“始业式”，向青年学子发出“爱国三问”：你是中国人吗？你爱中国吗？你愿意中国好吗？从此爱国初心成为南开大学的风骨，镌刻在每个南开人的心中。抗战期间，南开大学和清北一起创建了西南联大，弦歌不缀，培养了众多的爱国青年。因为这个缘故，南开大学在建国初期和北京大学、清华大学一起成为众多有志青年心中最神圣的大学。
年天津解放，南开大学被接管，当年中法大学的经济系、生物系，以及河北省立法商学院的大部分学生转到南开大学。而在当年年底，南开大学的教育系并入了北京师范大学，这基本上相当于是年全国院系调整的预演，或者说是试点。
而年的全国院系调整，让南开大学从文、理、工、政经4个学院的综合性大学，变成了文理为主的苏联模式综合性大学。当时并入南开大学的有天津大学的数学系和物理系，津沽大学的贸易系、会计系和企管系，而南开大学的工学院打包交给了天津大学。虽然从现在的角度来看，南开大学的院系调整基本是有进有出，基本达到了收支平衡，但由于缺失了工学院，在当时以工业为主要发展方向的大趋势下，实际上是得不偿失。
经历过院系调整之后的南开大学元气大伤，年全国6所重点大学无缘入选，年20所全国重点大学也无缘入选，而同城的天津大学入选了，直到年全国64所重点大学时才瞥见南开大学的身影。而在年，南开大学的贸易、企业管理、会计、金融、财政、统计等经济管理科系调出，参与组建河北财经学院。
在年，南开大学物理二系的原子核物理和放射化学两个专业的师生，整体并入了兰州大学。当时南开大学的物理系非常强，年建成了中国高校第1座实验性原子反应堆“南开1号”，而物理二系是在年成立的，最后支援了兰州大学。综合来看兰州大学，北京师范大学，天津大学3所大学，以及天津财经大学这所地方财经类强校，都有南开大学的血脉。
上世纪90年代对于南开大学的发展至关重要，当时是的评选时期，全国众多的高校纷纷合并组建综合类大学。年原属外经贸部的天津对外经济贸易学院，这所部属大学并入了南开大学，第2年南开大学顺利的入选了大学。
到了年之后又开启了大学的评比，又掀起了一波高校合并潮。当时的上层领导计划首批遴选10所大学，其中9所大学的名额已经确定，这就是如今的C9高校。第10所大学的名额，引起了很多高校的争夺，当时上面推出了南开大学和天津大学合作的计划，根据“共建、调整、合作、合并”的方针等两所大学合并之后将第10个大学的名额授予。
但是由于两校的师生都比较反对合并，谁也不想丢失自己的校名校史，合并结果最后不了了之，两校之间原本连通的天南街也筑起了围墙。虽然之后由于大学名额扩充，天津大学和南开大学在年同时入围，但是由于没有经过合并，事实上已经和C9高校拉开了差距。
不过天津大学和南开大学，尽管经历了和校风波曾经闹得不愉快，不过后来又冰释前嫌，携手共进。而南开大学在第5轮学科评估中也是扬眉吐气，在网传的学科评估数据中，南开大学共获得4个A+学科，终结了没有A+学科的窘境。而南开大学能否重铸昔日的辉煌，让我们拭目以待！
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